Správní území obce leží v clenitém území, zahrnujícím povodí Mokřanského potoka s několika přítoky a povodí Křivoveského potoka s přítoky. Soutok mají až mimo území obce.
Vodní toky v povodí jsou dešťovo–sněhového typu. Odtokové poměry jsou nepříznivé.
Povodňové nebezpečí vzniká při zvýšených objemech srážek co do intenzity nebo doby trvání, kdy odtok z území se kumuluje v recipientech a dochází k vybrežování vody a zaplavování jejich inundačních území.
V oblasti je vetší množství vodních děl, a to rybníků, vetšinou nad zastaveným územím. V poslední době je jejich technický stav postupně zlepšován, probíhají rekonstrukce a opravy funkčních objektů, revitalizace a doplňování příslušné dokumentace (Pasporty, Manipulační řády, Provozní řády, Povolení k nakládání s vodami).
Inundanční území Mokřanského potoka
Při povodních na Mokřanském potoce (nebo Křivoveském potose) voda vybřežuje v zastavěném území obce Velké Popovice a/nebo jejích částí – koryto potoka zde prochází v těsné blízkosti obytné zástavby, zahrad, pozemků i podél místních komunikací. V inundančním území se vyskytuje řada mostů, propustků a lávek, které kapacitu koryt potoků a jejich přítoků snižují, kdy k navýšení průtoků v korytech může dojít, jak ukazují historické zkušenosti, i malou kapacitou rybníků v obci (Pivovarský rybník, Klášterní rybník, Kovářský rybník, Farský rybník, Zahradníček, Habří, Veselý rybník) a přelitím jejich hrází. V případě vylití tedy dojde k zatopení jak zahrad, sklepů, garáží, zaplavení studní obyvatel, silnic, a přízemí domů, ležících v blízkosti toků v celém inundačním území ( Velké Popovice + části).
Kritickými místy při průchodu povodní jsou profily mostů, propustků a lávek přes Mokřanský nebo Křivoveský potok nebo přes jejich přítoky.
OPATŘENÍ OBECNÉ POVAHY - stanovená záplavová území vč. aktivních zón - Mokřanský potok
Pojem „záplavová území“ je dle ustanovení § 66 vodního zákona (č. 254/2001 Sb.) „administrativně určené území, které mohou být při výskytu přirozené povodně zaplavena vodou.“ Rozsah záplavových území je povinen stanovit na návrh správce vodního toku vodoprávní úřad. Záplavové území je vymezeno rozhodnutím věcně příslušného krajského úřadu - Středočeského kraje na základě podkladů od Správce vodního toku - Lesy ČR, s.p. - STOP Vltavy, Benešov.